直接熒光法DEFT（Direct Epifluorescent Filter Technique）是利用電離輻射對食品樣品菌落計數的方法，操作簡便，具有高通量性。將樣品通過過濾器后，吖啶橙染色，在紫外顯微鏡下活細胞能觀察到橘黃色，而死細胞染成綠色，可以統計出樣品中所有菌落的總數。原料乳用濾膜過濾后染色，計數得熒光假單胞菌相關性系數為0.91，且在25min內完成檢測。相對于傳統的平板計數方法，DEFT 大大縮短檢測時間，利用其原理，可以實現對多種食品中菌落數的快速檢測。但是 DEFT 的靈敏度不高，只能用于檢測一定范圍內菌落數，當食品中菌數含量較少時沒有良好的線性關系，且實驗儀器比較昂貴，在工業生產中不能很好的適用。