多伴隨鄰近組織損害癥狀。動眼神經核損害常合并內側縱束損害，出現眼內外肌癱瘓與雙眼同向運動障礙；展神經核損害常合并面神經膝部、三叉神經核、內側縱束損害，出現外展神經、三叉神經、面神經麻痹，以及雙眼同向運動障礙；滑車神經很少單獨受損，如果核性病變，會損害更多的鄰近組織如錐體束、感覺通路，則可出現交叉性癱瘓，如中腦的Weber綜合征、腦橋的Foville綜合征等。所以核性病變的主要特征為：
（1）眼球運動神經的核性麻痹是雙側性的，但不對稱。
（2）選擇性的損害部分眼肌，出現分離性眼肌麻痹。
（3）出現瞳孔縮小，對光反應消失而調節反應存在。
（4）常出現眼球運動神經核周圍組織的損害，并伴隨長束征。