研究團隊揭示海洋無脊椎動物RNA病毒的遺傳多樣性

　　5月6日，《中國科學：生命科學》（SCIENCE CHINA Life Sciences）在線發表了中國科學院上海巴斯德研究所研究員崔杰課題組題為Virome in Marine Ecosystems Reveal Remarkable Invertebrate RNA virus Diversity的研究成果。

　　海洋蘊藏著豐富的資源，具有開發潛力；海洋生物安全問題同樣需要引起足夠的重視。海洋中不僅存在尚未被發現的動、植物物種，還存在數量更龐大、種類繁多的微生物。傳統的海洋病毒研究多集中在以噬菌體為代表的DNA病毒上，對多樣性高、基因組不穩定的RNA病毒的遺傳多樣性、分布特征及傳播模式等均不清楚。

　　該研究中，研究人員從不同海域共采集到3門6綱58種的海洋無脊椎動物樣品，并利用宏轉錄組的測序方法對不同物種的RNA病毒組進行研究。研究人員使用改進的生物信息分析方法，鑒定出涵蓋9個病毒家族（Durnavirales、Totiviridae、Bunyavirales、Chuviridae、Picornavirales、Flaviviridae、Hepelivirales、Solemoviridae、Tombusviridae）的363個RNA病毒，其中的315個與已知的RNA病毒相似度較低，被認為是全新的RNA病毒。該研究首次報道了海洋漢坦樣病毒，其較陸地漢坦病毒更古老，因此，提出了漢坦病毒可能具有海洋起源的假說。結合基因組結構和統計學分析，研究人員展示了豐富的海洋病毒遺傳多樣性和病毒基因組可塑性，揭示了不同海域間、不同宿主類別間可能存在的病毒傳播現象。整體而言，該研究通過解析海洋無脊椎動物RNA病毒組，描繪病毒生態圈，為海洋RNA病毒的起源、進化、傳播提供了重要見解。

　　碩士研究生張譽譯和科研助理陳毅聰為論文的共同第一作者，崔杰為論文通訊作者。研究工作得到國家自然科學基金、中科院分子病毒與免疫重點實驗室等的資助。

圖1.無脊椎動物轉錄組中病毒的病毒分布和多樣性：上方的柱狀圖展示了每個文庫中的PE reads數目，不同顏色代表不同的樣品采集地點：東海——紅色，黃海——黃色，南海——藍色，每個文庫的名稱和宿主的分類在柱狀圖的頂部展示。下方的柱狀圖展示了每個文庫中發現的病毒種類和數量

圖2.病毒跨宿主傳播速率與病毒數目的相關性：橫坐標反映了病毒的數量，縱坐標反映了病毒跨宿主傳播事件的頻率，連線和灰色區域代表了線性回歸分析的擬合曲線以及95%的置信區間