隨全球人口老齡化程度加劇,實現健康老齡化是目前亟待解決的社會問題和科學問題.近年來,隨衰老相關研究成果不斷增多及高通量測序技術日益發展,衰老相關多組學數據逐漸增多.然而目前,尚缺乏一個綜合性的、整合衰老生物學多組學數據的數據資源庫.
中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)研究員鮑一明研究組、研究員張維綺研究組和中科院動物研究所研究員劉光慧研究組、研究員曲靜研究組,合作建立Aging Atlas數據庫.該數據庫從常規轉錄組、單細胞轉錄組、表觀基因組、蛋白質組及藥物基因組等層面,整合衰老相關數據集,實現不同條件下基因表達調控隨衰老變化趨勢的匯聚融合.該數據庫中,用戶可實現交互查詢和聯合分析不同層次組學數據等功能;數據庫將不斷完善,建立多層次組學間的整合分析和數據呈現,并形成升級版本;數據庫提供歸屬不同通路的衰老相關基因集,使用戶可更深入全面地了解特定基因和通路在衰老生物學中的意義.Aging Atlas提供開放的數據共享平臺,用戶可在上傳界面進行原始數據和處理后數據的上傳操作,為實現全球數據共享提供便利.Aging Atlas的建立旨在為世界范圍內衰老相關大數據的統一匯交、集中存儲、安全管理、開放共享及前沿交叉研究和轉化應用提供助力.相關研究成果以Aging Atlas: a multi-omics database for aging biology為題,在線發表在Nucleic Acids Research上.
Aging Atlas數據庫首次實現對與衰老相關的不同層次的多組學數據的收錄和整合,其對用戶免費開放,且持續實時更新,將有助于推動衰老相關的基礎研究和臨床轉化應用的發展.Aging Atlas希望在廣大科學工作者的支持下,不斷吸納更多高質量的衰老研究數據,以更好地服務衰老生物學和老年醫學的發展.
該數據庫由北京基因組所、動物所、中科院干細胞與再生醫學創新研究院、中科院干細胞與再生醫學科學數據中心、首都醫科大學宣武醫院等合作完成.數據庫的建設得到北京基因組所研究員楊運桂、慈維敏、任捷、韓大力,動物所研究員宋默識、周兵和副研究員馮桂海,中科院生物物理研究所所研究員陳暢,北京大學教授湯富酬教授、趙揚,浙江大學教授郭國驥和同濟大學教授尹曉磊的指導和支持.研究工作得到科技部、國家自然科學基金委、中科院和北京市等的資助.
Aging Atlas數據庫
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