(1)在一定濃度時，凝膠透明，有彈性，機械性能好；
(2)化學性能穩定，與被分離物不起化學反應，在很多溶劑中不溶；
(3)對pH和溫度變化較穩定；
(4)幾乎無吸附和電滲作用，只要Acr純度高，操作條件一致，則樣品分離重復性好；
(5)樣品不易擴散，且用量少，其靈敏度可達10-6ug
(6)凝膠孔徑可調節，根據被分離物的分子量選擇合適的濃度，通過改變單體及交聯劑的濃度調節凝膠的孔徑；
(7)分辨率高，尤其在不連續凝膠電泳中，集濃縮、分子篩和電荷效應為一體。因而較醋酸纖維薄膜電泳、瓊脂糖電泳等有更高的分辨率。