1.生理變化：
①年齡變化：新生兒NAP活性增高，以后下降。兒童期各年齡大致相似，成年期較兒童期活性減低，老年期更低。
②應激狀態下的變化：緊張、恐懼、激烈運動等NAP活性可增高。
③月經周期中的變化：經前期增高，行經后降低，經后期恢復。
④妊娠期的變化：妊娠2～3個月的NAP積分值輕度增高，以后逐月增高，分娩時達高峰，產后則恢復正常。
2.病理性變化：
①感染：細菌性感染時NAP積分值增高。在細菌性感染中球菌性感染較桿菌性感染為高；在球菌性感染中，急性較慢性為高。病毒性感染時，NAP積分值一般無明顯變化。因此本染色法有時可幫助鑒別細菌性感染和病毒性感染。
②血液病：慢性粒細胞白血病的NAP積分值明顯減低，常為“0”，緩解時NAP積分值上升到正常。類白血病反應時的NAP積分值明顯增高，中性桿狀核粒細胞的堿性磷酸酶活性增強，甚至中性晚幼粒細胞也呈陽性反應。因此本法常用來鑒別慢性粒細胞白血病(簡稱慢粒)和類白血病反應及觀察慢粒療效的指標之一。
③其他：紅白血病的NAP積分值減低，慢性淋巴細胞白血病、骨髓纖維化、原發性血小板增多癥和紅血病等疾病的NAP積分值可增高；NAP積分值減低，也可見于鐮形細胞性貧血、嚴重型嗜酸性粒細胞增多癥、家族性低磷酸酶血癥。
3.其他：
應用腎上腺皮質激素、雌激素和ACTH后NAP積分值增高。