核磁共振分析技術是通過核磁共振譜線特征參數（如譜線寬度、譜線輪廓形狀、譜線面積、譜線位置等）的測定來分析物質的分子結構與性質。它可以不破壞被測樣品的內部結構，是一種完全無損的檢測方法。同時，它具有非常高的分辨本領和精確度，而且可以用于測量的核也比較多，所有這些都優于其它測量方法。因此，核磁共振技術在物理、化學、醫療、石油化工、考古等方面獲得了廣泛的應用。
●磁共振顯微術（MR microscopy, MRM/μMRI）是MRI技術中稍微晚一些發展起來的技術，MRM最高空間分辨率是4μm，已經可以接近一般光學顯微鏡像的水平。MRM已經非常普遍地用作疾病和藥物的動物模型研究。
●活體磁共振能譜（in vivo MR spectroscopy, MRS）能夠測定動物或人體某一指定部位的NMR譜，從而直接辨認和分析其中的化學成分。