射頻系統
1) 射頻發生器由發射器、功率放大器和發射線圈組成。射頻脈沖是誘發磁共振現象的主導因素，發射的脈沖頻率與主磁體產生的靜磁場正交，發射的脈沖頻率也需與靜磁場強度相匹配。
2) 接受部分由接收線圈和低噪聲信號放大器組成。探測器接收的信號傳送預放大器，增加信號強度，可降低后處理過程中的信噪比。然后傳至位相敏感檢測器，發生調節，從信號中減去接近larmor頻率的五官波形，經計算機處理并轉化為MRS譜圖。
數據處理及圖像顯示系統
磁共振波譜分析儀一般采用固定電磁波頻率，然后連續改變外加磁場強度進行掃描。原子核頻率與照射頻率相同時發生共振，原子核發生躍遷，接收線圈因感應而產生電流，經放大器放大后在記錄儀上描記下來，從而獲得磁共振信號。