領域
離子色譜主要用于環境樣品的分析，包括地面水、飲用水、雨水、生活污水和工業廢水、酸沉降物和大氣顆粒物等樣品中的陰、陽離子，與微電子工業有關的水和試劑中痕量雜質的分析。
另外在食品、衛生、石油化工、水及地質等領域也有廣泛的應用。
經常檢測的常見離子有
陰離子：F-, Cl-, Br-, NO2-,PO43-,NO3-,SO42-,甲酸，乙酸，草酸等。
陽離子：Li+, Na+, NH4+,K+, Ca2+,Mg2+, Cu2+, Zn2+, Fe2+, Fe3+等。
離子色譜儀分離測定常見的陰離子是它的專長，一針樣品打進去，約在20分鐘以內就可得到7個常見離子的測定結果，這是其他分析手段所無法達到的，關于陽離子的測定離子色譜法與AAS和ICP法相比則未顯示出優越性。
環境： 大氣成分（粉塵、顆粒物、霧、酸氣）、酸雨、水質分析
食品： 污染成分、添加劑、固有成分、摻假、生產過程監控
農業： 農藥、肥料、土壤、飼料、糧食、植物分析
醫學： 血液、尿、輸液成分、臨床檢查、人體微量元素分析
生物： 蛋白質分離純化、
制藥： 植物藥材、礦物藥成分、制劑成分分析
材料： 金屬材料、半導體材料、表面處理、超純水分析
工業： 原料分析、產品質量控制、電解電鍍液解析、造紙
化工： 原料和產品分析、反應過程監控
日化： 化妝品、洗滌劑、清潔劑、原料和產品成分分析