根據離心方式的不同，可分為差速離心法和密度梯度離心等。
（1）差速離心：又叫分級離心法，是生化分離中最為常用的離心分離方法。它指采用低速和高速兩種離心方式交替使用，用不同強度的離心力使具有不同密度的物質分級分離的方法。離心后把上清液與沉淀分開，然后再將上清液加高轉速離心，分離出第二部分沉淀，如此往復加高轉速，逐級分離出所需要的物質。
（2）密度梯度離心：也叫區帶離心，即離心是在具有連續密度梯度的介質中進行。將試樣鋪放在一個密度變化范圍較小、梯度斜度變化比較平緩的密度梯度介質表面，在離心力場作用下試樣中的顆粒按照各自的沉降速率移動到梯度介質中的不同位置，而形成一系列試樣組分區帶，使不同沉降速率的顆粒得以分離。