一般來說，種子在儲藏的過程中，最大的克星就是高溫、高濕和陽光，而使用種子低溫低濕儲藏柜不僅可以有效隔絕高溫高濕環境，避免這些惡劣氣候環境對種子品質的影響，同時還能夠根據不同種子的儲藏特性來定制種子低溫低濕儲藏柜中的溫濕度環境，為各類種子的安全、長期儲藏創造條件。
以前很多農民喜歡將沒有用完的種子放入冰箱（不是冷凍區）中儲藏，其作用也是通過低溫低濕的環境來避免種子品質惡化，等來年的時候依然能夠使用，種子低溫低濕儲藏柜的應用原理也是如此，只不過作為專用于種子安全儲藏的設備，種子低溫低濕儲藏柜更加專業和高效，在安全方面也更有保障。
很多時候外界的自然環境對于種子儲藏的影響是十分大的，比如在夏季高溫高濕的環境下，種子極易發生劣變，在陰雨天氣，種子也常常因為發生返潮現象，造成種子霉變，即使是做好了保管措施，由于天氣環境影響所造成的損失也往往是無法避免的，因為外界環境始終無法完全隔絕，但是種子低溫低濕儲藏柜不同，它提供了一個完全的封閉空間，將種子儲藏的環境和外界高溫高濕環境有效隔絕了開來，因此無論外界環境如何變化，它都能夠輕松應對，保障種子的儲藏安全。
種子低溫低濕儲藏柜不僅只是一個密封的空間而已，如根據種子長期儲藏的機理，種子在低溫低濕的環境條件下，能夠有效延長其儲藏壽命，保持其良好的生活力，因此種子低溫低濕儲藏柜研發的時候充分考慮了種子的這種儲藏技術，應用精準的控制手段和設備及時調控的方式將種子的儲藏環境維持在這樣的低溫低濕環境之中，這樣既可以避免外界環境干擾，又能夠滿足種子長期安全儲藏的條件，種子的儲藏壽命自然大幅度的提高，而種子損失則是大幅度的降低，種子生產的經濟效益和農業生產的綜合效益也更有保障了。