種質資源管理系統除具有數據瀏覽、信息查詢、報表標簽預覽打印、數據錄入編輯等常用功能外，更考慮到實際應用中，大量、頻繁的數據信息查詢的需求，在數據信息查詢方面賦予系統更靈活多樣的方式和更強大的能力。同時考慮到基層科研人員的實際情況，種質資源管理系統具有操作簡便、易于維護，安全性較好的特點，適宜于省級及以下棉花科研單位應用。
種質資源管理系統應符合基層農業科研單位棉花種質資源等數據管理的要求，滿足科研工作的需要，并應做到界面友好、操作直觀簡便、實用安全；應采用模塊化程序設計方法，以便于使用和維護；能夠根據不同用戶要求進行數據的添加、刪除、修改、備份、查詢及輸出等操作。最后能根據不同用戶的權限等級賦于不同的操作權力，保證一定的安全性。
種質資源管理系統包括性狀表記錄的性狀字段的任意條件查詢，按種質資源材料的名稱動態查詢，按一定范圍的纖維比強度查詢，全庫記錄的表格瀏覽。可對查詢結果按農藝性狀一、農藝性狀二、農藝性狀三、主要農藝性狀、纖維品質、抗逆性主要性狀、主要纖維品質進行全屏預覽、打印，以及輸出到文本文件、NLOFK表格保存。