把埃博拉病毒基因組測序監測系統裝進行李箱實現實時監測并不是夢。英國伯明翰大學Nicholas Loman團隊開發了一個基因組監測系統,可以用標準的航空行李運送到疾病檢測現場,并在樣本收集24小時內得出檢測結果。近日發表于《自然》的一項研究介紹了在西非幾內亞最近的埃博拉疫情中,成功使用該系統進行的實時監測。
西非埃博拉病毒新瑪可拉(Makona)毒株已導致超過11000人死亡,該病毒平均每個基因組中有16~27個遺傳變異。基因組測序可以用來追蹤這種變化,且日益受到醫護工作者的歡迎,因為只要測序結果分析得足夠快,就可以給他們提供信息并采取病毒控制措施。然而,由于當地缺少測序能力,且遠距離運輸樣本測序有難度,西非埃博拉疫情期間采取基因組監控十分零散。
Loman團隊開發的基因組監測系統使用一個重量不足100克的DNA測序裝置,既可以用標準航空行李運送,也可以插入筆記本電腦的USB接口。研究團隊使用該系統測序并且分析了2015年3~10月收集的142例埃博拉病毒樣本,并可在24小時內得到分析結果,測序過程需要的時間尚不到1小時。研究者認為,這顯示出在資源缺乏的情況下進行實時基因組監控是可行的。
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