等電聚焦電泳色譜儀是利用蛋白質分子或其它兩性分子的等電點不同，在一個穩定、連續和線性的pH梯度中進行分離，檢測方法有染色法、掃描法和其它檢測方法。
一、染色法：
1、考馬斯亮藍染色法。
2、銀染色法。
3、同工酶染色法。
4、專一蛋白染色法。
5、熒光標記以及免疫法。
二、掃描法：
激光光源強度大，單色性好，掃描IEFE區帶最合適。
操作程序和條件必須嚴格相同。
三、其它檢測方法：
1、電泳轉移法。
2、雙向電泳法。
3、滴定曲線分析法。
