1、甲硝唑能抑制華法林和其他口服抗凝藥的代謝，加強它們的作用，引起凝血酶原時間延長。
2、與苯妥英鈉、苯巴比妥等誘導肝微粒體酶的藥物合用，可加強本品代謝，使血藥濃度下降，而苯妥英鈉排泄減慢。
3、與西咪替丁等抑制肝微粒體酶活性的藥物合用，可減慢本品在肝內的代謝及其排泄。延長本品的血消除半衰期(t1/2β)，應根據血藥濃度測定的結果調整劑量。
4、本品可干擾雙硫侖代謝，兩者合用時患者飲酒后可出現精神癥狀，故2周內應用雙硫侖者不宜再用本品。
5、本品可干擾血清氨基轉移酶和乳酸脫氯酶的測定結果，可使膽固醇、三酰甘油水平下降。