依諾肝素鈉皮下注射的最大效應時間為3~5h,持續時間為24h,生物利用度為92%,這取決于抗凝血因子Ⅹa的活性。動物研究顯示依諾肝素鈉在腎、肝和脾選擇性聚集,分布容積(Vd)為6~7L/kg。其半衰期平均為4.5h(3~6h),老年人為6~7h,腎衰患者平均延長1.7倍。腎臟是依諾肝素鈉排泄的基本途徑,主要通過腎小球濾過。