克雷伯氏菌屬是歸屬于腸桿菌科，粗短的桿菌，大小約為0.3-1.0μm-0.6-6.0μm。菌體常平直，有時稍膨大，單個、成對或短鏈狀排列，無鞭毛和芽胞，無動力，具有明顯的莢膜，久經傳代后可失去莢膜，革蘭氏染色陰性。多數菌株具有菌毛，有的屬于甘露糖敏感的I型菌毛，有的則為抵抗甘露糖的Ⅱ型菌毛，也有的兩者兼而有之。DNA中G+C mol%為53%-58%。
