1、卡那霉素注射制劑與其他氨基糖苷類合用或先后局部或全身應用，可增加耳毒性、腎毒性以及神經肌肉阻滯作用。
2、卡那霉素注射制劑與神經肌肉阻斷藥合用，可加重神經肌肉阻滯作用，導致肌肉軟弱、呼吸抑制等。
3、卡那霉素注射制劑與卷曲霉素、順鉑、依他尼酸、呋塞米或萬古霉素(或去甲萬古霉素)等合用，或先后連續局部或全身應用，可能增加耳毒性與腎毒性。
4、卡那霉素注射制劑與頭孢唑林鈉合用會增加腎毒性。
5、卡那霉素注射制劑與頭孢噻吩或頭孢唑林局部或全身合用可能增加腎毒性。
6、卡那霉素注射制劑與多粘菌素類注射劑合用，或先后連續局部或全身應用，可增加腎毒性和神經肌肉阻滯作用。
7、其他腎毒性藥物及耳毒性藥物均不宜與本品合用或先后應用，以免加重腎毒性或耳毒性。