反式棕櫚油酸也具有調節糖脂代謝的功能，已經被當做降低2型糖尿病和冠心病風險的生物標志物。Mozaffarian等以不同地區的人種為研究對象，發現反式棕櫚油酸和低密度脂蛋白的含量相關，服用棕櫚油酸可以降低乳制品和高脂飲食造成的糖尿病和動脈粥樣硬化風險。Jaudszus等研究了反式棕櫚酸的產生途徑，發現除了通過飲食攝取外，反式棕櫚油酸還可以通過內源性的氧化反應由反式棕櫚酸得到，轉化率約為17%。
但是，對于順、反兩種棕櫚油酸功能性差異的對比研究還未見報道。
