如果一個(單鏈)核苷酸的序列和它的反向互補鏈的序列一樣,那么這個核苷酸序列就是回文序列。回文序列結構不僅在DNA中存在,在RNA中也常因堿基的互補而常出現類似的結構,有利于穩定RNA的結構和行使功能。回文序列也經常出現在組成蛋白質的肽序列中,但它們在蛋白質功能中的作用尚不清楚。
短的回文結構可能是一種特別的信號,如限制性內切酶的識別序列。較長的回文結構容易轉化成發夾結構,可能有助于DNA與特異性DNA結合蛋白結合。