細菌進入腹腔后，引起腹膜充血、水腫及滲出。滲液內含大量中性白細胞、壞死組織、細菌和凝固的纖維蛋白，一般呈混濁性滲液或呈稀薄膿性液。因滲液量大而纖維蛋白含量較少，形成局限性膿腫者較少。鏈球菌膿液稀，很少產生纖維蛋白性粘連。葡萄球菌、大腸埃希桿菌及肺炎球菌引起的膿較稠，粘連較多。感染控制后，膿液即被吸收，腹腔內纖維蛋白性粘連也于1周內吸收，部分患兒腹內有漿膜破壞或壞死組織，即會留下廣泛而頑固的腸粘連，為引起粘連性腸梗阻的潛在因素。
由于滲出液刺激的腸壁水腫導致腸蠕動受抑制，腸膨脹、麻痹；大量的細胞外液滲出引起脫水、電解質紊亂，嚴重時循環血量減少，導致循環衰竭；同時大量的細菌和毒素被腹膜吸收，可產生毒血癥、敗血癥或中毒性休克。