慢性丙型肝炎多由急性丙型肝炎演變而來，分為慢性肝炎輕度和慢性肝炎中度，因臨床上癥狀體征常不顯著，以單項ALT增高為唯一異常現象的為數甚多，故常為亞臨床型。如果有癥狀，常表現為乏力、納差、關節疼痛、厭食、惡心和發熱。后期可出現黃疸、腹脹或食管靜脈曲張破裂出血等。由于慢性丙型肝炎患者癥狀多輕微，并有較大比例的患者無明確的傳播途徑，故基于上述臨床表現很難做明確診斷，而需依賴實驗室檢查。
