引起隱球菌病,一種亞急性或慢性的感染,最常侵犯中樞神經系統組織,但是偶爾也可導致皮膚、骨骼、肺或其他內臟器官的病變。新型隱球菌引起的腦膜炎在艾滋病患者中非常常見。除格特隱球菌外。通常認為該屬的其他種是不致病的,只是偶爾會引起嚴重免疫抑制狀態患者致病。自然環境中最常見的新型隱球菌的來源是鴿子糞便。