患兒肝脾腫大的原因不同，新生兒臨床癥狀不一。除有肝脾腫大外，可有發熱或體溫不升、不吃奶、體重不增加、腹脹、黃疸等癥狀，常和感染有關，如新生兒敗血癥、新生兒肝膿腫、新生兒肝炎綜合征等。半乳糖血癥患兒有低血糖驚厥、嘔吐、黃疸、白內障等。阻塞性黃疸、新生兒肝炎綜合征，有嚴重的黃疸、灰白色大便和肝脾腫大。新生兒溶血癥、瘧疾等，有貧血、黃疸伴有肝脾腫大。有出血傾向和紫癜，多見于新生兒血小板減少性紫癜和白血病等。部分患兒有特殊面容、毛發異常等。
