雜環化合物常以俗名命名，較少用系統命名。系統命名是指以相應的碳環為母體而命名。例如，含兩個不飽和鍵的環戊二烯稱為茂，與之相應的一種雜環化合物，例如吡咯，可以看成是由“NH”取代了茂中的“CH2”而成 ，稱為氮（雜）茂。依此類推，吡啶稱為氮（雜）苯，喹啉稱為氮（雜）萘等，但一般仍習慣于用俗名命名。
雜環化合物的中文名稱是以口字旁標明其為雜環，另半部分表明雜原子的種類。例如，以喃、噻分別表示為含氧、硫的雜環；以咯、唑、嗪、啶、啉表示為含氮的雜環，這些字是根據英文字的尾音創造的，其中咯、唑表示為五元含氮雜環，其余的指六元含氮雜環。雜原子超過一個者分別以二、三等字表示相同雜原子的數目。
1、只含一個雜原子或一個以上相同雜原子的雜環，雜原子編最小號；
2、含兩個不同雜原子時，不同雜原子的編號順序為氧、硫、氮。