主要臨床表現為，在4日左右的發熱、頭痛等前驅期癥狀后，出現以非心源性肺水腫和高病死率（52.4%～78.0%）為特征的急性呼吸衰竭，重癥3～7日死亡，生存者則很快恢復，無后遺癥。其發病機制主要是病毒的直接致病作用，腎臟是早期原發性損傷器官，病毒是腎損傷的直接因素。
癥狀包括疲勞、發燒和肌肉酸痛，以及頭痛、頭暈、寒顫和腹痛。晚期癥狀可能包括咳嗽和呼吸急促。
漢坦病毒實驗診斷方面的研究，主要集中于重組抗原的應用和實驗診斷方法的快速、敏感和特異。
多項報告對HFRS和HPS的后遺癥進行了調查，研究表明兩種疾病的恢復病人與健康人比較，分別存在腎臟或肺功能的異常。M.Howard等對患有HPS的孕婦進行了調查，結果表明患有HPS的孕婦預后與其他HPS患者相同，患有HPS孕婦的胎兒與其他患有成人呼吸窘迫綜合征的孕婦的胎兒差異不大，研究中沒有發現SN病毒在人類垂直傳播的現象。