1、菌斑
粘附于牙齒表面的微生物群，不能用漱口、水沖洗等去除。
2、牙石
牙石是指沉積在牙面上的礦化的菌斑，根據其沉積部位和性質分為齦上牙石和齦下牙石兩種。
（1）齦上牙石位于齦緣以上的牙面上，肉眼可直接看到。在牙頸部沉積較多，特別是在大涎腺導管開口相對處,如上頜磨牙的頰側和下頜前牙的舌側沉積更多。齦上牙石中無機鹽的主要來源是唾液中的鈣、磷等礦物鹽。
（2）齦下牙石位于齦緣以下、齦袋或牙周袋內的根面上，肉眼不能直視，必須用探針探查，方能知其沉積部位和沉積量。齦下牙石中無機鹽的主要來源是齦溝液。
牙石對牙周組織的危害，主要是構成了菌斑附著和細菌滋生的良好環境。
3、創傷性咬合
在咬合時，若咬合力過大或方向異常，超越了牙周組織所能承受的合力，致使牙周組織發生損傷的咬合，稱為創傷性咬合。創傷性咬合包括咬合時的早接觸、牙合干擾、夜間磨牙等。
4、其他
包括食物嵌塞、不良修復體、口呼吸等因素也促使牙周組織的炎癥發生。