多數病毒性疾病均能自愈，少數嚴重感染者可致死亡。尚缺乏特效治療，仍以抗病毒治療及全身支持療法和對癥治療為主。用抗生素或磺胺治療無效，一些抗病毒藥物如碘脫氧尿嘧啶核苷、阿糖腺苷、無環鳥苷對皰疹病毒感染等有一定療效。干擾素為廣譜抗病毒藥，對DNA和RNA病毒均有抑制作用。三氮唑核苷對某些病毒如流行性出血熱病毒，可能有抑制作用。金剛烷胺可以預防流感。中草藥對減輕一些病毒性疾病的癥狀、縮短病程可能有一定的療效。
