棘球蚴病臨床表現極其復雜，主要有：
1、毒性和過敏反應
如食欲減退、體重減輕、消瘦、發育障礙、惡病質現象、蕁麻疹和粒棘球絳蟲生活史 血管神經性水腫等。若棘球蚴液多量滲出或溢出可引起嚴重的過敏反映而致過敏性休克，甚至死亡。
2、繼發性感染
如肝棘球蚴蚴囊破裂可今日膽道，引起急性炎癥，出現膽絞痛、寒戰高熱、黃疸等。破入腹腔可致急性彌漫性腹膜炎。肺棘球蚴囊如破裂至支氣管，可咳出小的生發囊、子囊和囊壁碎片等。
3、局部壓迫和刺激癥狀
受累部位有輕微疼痛和墜脹感。如寄生肝可有肝區疼痛。在肺部可引起干咳、咯血、呼吸急促、胸痛等道癥狀；腦部受累則出現顱內壓增高癥狀如頭痛、惡心、嘔吐、視付乳頭水腫、抽風甚至偏癱等。骨棘球蚴常發生于骨盆、椎體的中心和長骨的干骺端，破壞骨質、使之疏松、易造成骨折或骨碎裂。位置表淺的棘球蚴可在體表形成包塊，觸之堅韌，有彈性，叩診時可有震顫，包塊破門靜脈可致扶腹水若壓迫膽管可致阻塞性黃疸、膽囊炎等。