(一)腹痛：臍部或右下腹部疼痛，隱痛性，可急性發作或經常存在腹痛，為憋室發炎所致。伴有惡心、嘔吐、低熱。在下腹或臍部壓痛，肌緊張，白細胞增高，易誤診為急性或慢性 闌尾炎 ，故在闌尾手術時如炎癥不明顯，應常規檢查回腸100cm以內，以排除憩室炎。
(二)便血：小兒有間歇性便血、 貧血 或大量便血，典型者呈葡萄酒紅色便，應想到美克爾憩室，為憩室并發癥，多在6歲以內，約占并發癥的一半。
(三)小腸梗阻和穿孔：為憩室的重要并發癥，與腸梗阻和 腹膜炎 臨床表現一致。
(四)99m锝腹部掃描：為憩室含有異位胃粘膜，故用99m锝掃描在便血而原因不明的小兒可助診斷。
(五)X線鋇劑全腸道檢查：發現憩室即可確診，但少數多次X線檢查，也有漏診者。