患者持續性低熱、疲倦不適。臍部或右下腹常有持續性隱痛，有時陣發性加劇，也可表現為急腹痛，類似絞痛，伴惡心、嘔吐，可有腹瀉或便秘。查體臍周或左上腹、右下腹可觸及腫大的淋巴結，有壓痛，常疑為急性闌尾炎而施行手術。慢性腸系膜淋巴結結核時，可出現慢性中毒癥狀和營養不良，表現為長期不規則低熱、食欲減退、消瘦、貧血、乏力、腹瀉。有時可觸及團塊狀腫大的淋巴結，比較固定，不易推動。腫大的淋巴結可壓迫門靜脈使回流受阻，產生腹水及腹壁靜脈曲張；壓迫下腔靜脈引起下肢水腫；壓迫幽門致幽門梗阻；壓迫腸道致不完全性腸梗阻。成人可缺乏臨床癥狀，而表現為臍周觸及腹塊，剖腹探查時始發現為淋巴結結核。