有反流性食管炎的胃食管反流病患者，其病理組織學改變可有：①復層鱗狀況上皮細胞層增生；②乳頭向深皮腔面延長；③固有層內炎性細胞主要是中性粒細胞浸潤；④鱗狀上皮氣球因變；⑤糜爛及潰瘍。內鏡下不同程度的食管炎則表現為水腫、潮紅、糜爛、潰瘍、增厚轉白、瘢痕狹窄。Barrett食管是指食管與胃交界的齒狀線2cm以上出現柱上皮替代鱗狀上皮。組織學表現為特殊型柱狀上皮、賁門型上皮或胃底型上皮。內鏡下典型表現為粉紅帶紅白的食管粘膜呈胃粘膜的橘紅色，分布可為環形、舌形或島狀。
