成熟的葡激酶分子中含有136個氨基酸，相對分子質量為1．6×104～2．25×104，肽鏈中沒有二硫鍵，對其溶液中的構象研究表明，分子中有兩個相似大小的結構域，分子形狀類似兩頭易變的“啞鈴”。其等電點為6．8，半衰期為6～7 rain。成熟的葡激酶容易降解，N末端常缺少6或10個氨基酸殘基，但降解的葡激酶活性不受影響。按噬菌體的不同，葡激酶基因分為3種，即Sale￥C基因，Sak42D基因和SakSTAR基因。其中，Sak￥C基因序列全長1377 bp，只有一個開放閱讀模型框架，上游包括SD序列、-10區和-35區序列。結構基因從313位開始到804位止，第1個密碼子為ATG，最后一個密碼子為TAA。編碼N末端前27個氨基酸信號肽及163個氨基酸分子的蛋白質。