對于鱗狀乳頭型顱咽管瘤，可能對靶向治療有反應。
靶向治療是一種采用靶向藥物的治療方法，其作用的靶點是瘤細胞內使腫瘤能夠生存的突變位點，通過破壞這些突變位點而殺死腫瘤細胞。幾乎所有的乳頭狀顱咽管瘤細胞都含有一個稱為BRAF基因的突變。
應用BRAF抑制劑（如達布非尼和維羅非尼）和MEK抑制劑（如曲美替尼和考比替尼），針對這種突變的靶向治療可能是一種治療選擇。特殊的實驗室檢測可以揭示患者的顱咽管瘤是否含有乳頭狀細胞，以及這些細胞是否有BRAF基因突變。
