食管裂孔疝患者的典型癥狀可以包括胃食管反流癥狀，以及壓迫和消化道梗阻癥狀等方面的癥狀；急性胃扭轉者可引起消化道穿孔、缺血壞死，出現嘔血、黑便、貧血等癥狀，嚴重者可危及生命。
1、胃食管反流性癥狀
該癥狀表現為反酸和燒心，尤其是夜間平臥位或頭低位時加重。由于胃內酸性液體通過功能障礙或松弛的食管下括約肌反流入食管所導致，各型食管裂孔疝患者均可出現，但在I型滑動型裂孔疝中最常見。
2、壓迫和梗阻癥狀
該癥狀可表現為呼吸困難，吞咽困難，惡心、嘔吐，胸痛等，尤其是飽餐后加重。這是由于進入胸腔的胃或其他腹腔臟器壓迫肺、縱膈和食管，同時疝入胸腔的臟器發生扭轉而造成的消化道梗阻，多見于較大的食管旁疝。
3、伴隨癥狀
嘔血、黑便、貧血：食管裂孔疝尤其是食管旁疝由于長期的胃黏膜慢性病變，引起慢性上消化道出血，引起嘔血、黑便等癥狀，長期則會導致缺鐵性貧血。
哮喘、咽喉炎等：胃食管異常反流可引起喉和肺的病變，當反流物質通過環咽部括約肌進入下咽部，極有可能被誤吸入喉和氣管，誘發呼吸道癥狀的出現。
當進入胸腔的胃或臟器組織因狹窄的食管裂孔卡壓而出現梗阻或急性胃扭轉時，患者出現急性胸痛，無法進食，嚴重可引起上消化道的穿孔、缺血壞死，需要急診就醫。