心腦血管疾病
高同型半胱氨酸血癥的患者患冠心病、心肌梗死、中風、靜脈血栓栓塞和外周血管疾病的風險增加。同型半胱氨酸濃度每降低3μmol/L，缺血性心臟病的風險降低11%，中風的風險降低19%。
認知功能障礙
同型半胱氨酸水平輕度升高也可能增加患阿爾茨海默癥認知功能障礙、血管性認知功能障礙、帕金森氏病相關性認知功能障礙和多發性硬化性認知功能障礙的風險。
骨質疏松相關骨折
高同型半胱氨酸血癥是老年人骨質疏松性骨折的獨立危險因素。同型半胱氨酸水平輕度升高（男性＞20μmol/L，女性＞18μmol/L）即可顯著增加骨折的風險（男性升高4.1倍，女性升高1.9倍）。