朱利安實驗室完成的其他工作引發了朱利安對于類固醇的研究。早在迪保大學時，當朱利安試圖從加拉巴豆中分離出毒扁豆堿時，他得到了一種油并用酸類物質對其進行清洗。幾周之后，朱利安發現油中出現了結晶。進一步的分析表明這種結晶其實是豆固醇的水合物。固醇類是一種化學物質，大多屬于如同膽固醇一類的不飽和醇；通常會在動植物的組織中被發現。身體利用固醇類制造類固醇激素，這種激素在人體的各種活動中都很重要，對于從新陳代謝到性的成熟和發育都有重要的調節作用。制藥業也利用固醇類來合成類固醇激素。以前，人們通過從動物的膽汁中提煉固醇類，但是用這種辦法要得到供一個病人治一年病的相關藥物需要殺死成千上萬的動物，這種辦法無疑是很昂貴的。朱利安明白如果能從豆油中提煉出固醇類將會極大地造福人類，但是實際中要將其分離出來很困難。在格力登公司的時候，朱利安的全部精力被這件事情所占據。
1940年的一天，朱利安忽然注意到一桶豆油在與水混合后形成了一種白色物質，這使他想起了加拉巴豆油中形成的結晶體。朱利安通過后來對這種油類物質的進一步的研究發現了從豆油中提取固醇類的方法。這種方法首先將固醇類轉化成一種多空的泡沫，然后再進一步分離。隨后，他發現了在實驗室里從豆油中合成孕激素類黃體酮和睪酮的最佳方法。孕激素類黃體酮是一種在懷孕情況下大量產生的激素，主要用于保持子宮的位置。所以孕激素類黃體酮當時被用來防止流產，孕激素類黃體酮被用來治療生殖系統的毛病，比如經前綜合征和月經不調，此外它還是控制生育藥物的一種成分。睪酮是一種男性激素，這種激素對于性的成熟、生殖能力的維持和性沖動的產生具有重要的調節作用。在此之前，這兩種物質只能從大量的睪丸或卵巢中提取，或者從牛的腦部和脊髓中的膽固醇中獲得。所以，朱利安的發現無疑是一個巨大的進步。
1948年，研究者們發現可松體能夠緩解關節炎的癥狀。可松體是一種在結構上與孕激素類黃體酮和睪酮十分相關的另外一種類固醇類激素。可松體是由副腎腺最外面的皮層分泌的（副腎腺位于腎臟的上面）。可松體能夠調節人體中糖和鹽的水平，并幫助身體在壓力下正常反應。可松體能夠緩解發炎癥狀，對于治療由關節邊緣發炎而引發的風濕性關節炎很有療效。不幸的是要從膽汁酸中提純出可松體非常昂貴，要獲得一盎司的可松體要花上萬美元。朱利安以從豆類中提取孕激素類黃體酮為例向人們證明只需要花很少的錢就能夠獲得這些有用的物質。后來，朱利安又從孕激素類黃體酮中合成了脫氧皮甾醇。1952年，阿普約翰公司發現這個缺失的氧原子可以通過微生物學的方法添加上去，隨后對于孕激素類黃體酮和脫氧皮甾醇的需求急劇的上升。朱利安合成的脫氧皮甾醇為那些飽受各種疾病折磨的眾多患者提供了簡便而又便宜的治療機會。合成的可松體也被廣泛地用來制造那些用于治療由蚊蟲和有毒植物引發的瘙癢的高級藥膏上。
1950年，佩西·朱利安入選芝加哥年度人物，但是他仍須同種族歧視作斗爭。朱利安位于芝加哥橡樹公園白人社區中的房子在他搬進去的前一天被人刻意縱火。為了保證家里的供水，他甚至不得不威脅要使用法律手段。在朱利安一家搬進社區后，竟然有人往他的家里扔炸藥，恰好落在朱利安孩子們臥室的窗戶下。1951年，朱利安被拒絕進入芝加哥一個為著名科學家和T業家專門舉行的私人午餐會。但是朱利安從來都沒有后退，并且成為民權運動直言不諱的辯護者。