糞便顯微鏡檢查是臨床常規檢查的主要內容，用于檢查各種有形成分，如細胞、寄生蟲、結晶、細菌、真菌。許多寄生蟲感染的疾病均可以在糞便中查到病原體—寄生蟲卵或蟲體。糞便中常見的蟲卵和蟲體有蛔蟲、蟯蟲、鉤蟲、絳蟲、鞭蟲、阿米巴原蟲或包囊、血吸蟲、肺吸蟲、腸滴蟲、藍氏賈第鞭毛蟲等。常用的寄生蟲檢查法有常規涂片鏡檢法和集卵法等。
