雖然近年對SSc的治療取得了一定的進展，但仍面臨著諸多的困難，目前仍然沒有單一的藥物可以阻止SSc患者疾病進程，早期診斷、早期治療是影響治療效果和預后的關鍵。治療的目的在于預防內臟受累，改善已經受累的內臟的損害，提高患者生存率。
目前的治療方法：包括免疫調節治療、抗纖維化治療和針對受累臟器的特異性治療。治療的第一步是明確疾病亞型和階段。疾病早期患者可進展更快，而晚期纖維化則趨于穩定。目前研究顯示針對特定受累臟器的治療，可一定程度上改善患者生活質量，即延長患者的生存時間。
一、雷諾現象和肢端潰瘍
囑病人勿抽煙，手足注意避冷保暖，以免引起血管痙攣。藥物治療方面以擴血管藥物為主。二氫吡啶類鈣離子拮抗劑如硝苯地平可減少雷諾現象發作的頻率以及嚴重程度，指南建議作為SSc相關雷諾現象的一線治療，推薦用法為20毫克/次每日三次。靜脈注射伊洛前列素可用于治療嚴重的雷諾現象和肢端潰瘍。5型磷酸二酯酶抑制劑，如西地那非、他達拉非及內皮素一1受體拮抗劑在臨床上主要用于治療SSc相關肺動脈高壓。但近幾年有研究顯示，上述兩種藥物可提高患者肢端潰瘍的愈合以及減少新發肢端潰瘍的數量，在指南中均為A類推薦。
二、皮膚受累和肺間質病變
甲氨蝶呤可以改善早期彌漫性SSc的皮膚硬化，但未證實對皮膚病變晚期及其他臟器受累亦有效。故現僅被推薦用于治療彌漫性SSc的早期皮膚癥狀，其他免疫抑制劑如青霉胺、松弛素、秋水仙堿、環孢素等由于缺乏證據、毒副作用等指南未做推薦。糖皮激素亦可用于治療SSc皮膚病變的早期，但用量方面仍然存在爭議，考慮到激素與SSc腎危象風險增加有關，故推薦小劑量(15毫克/d以下)，應用中到大劑量時需要密切監測腎功能。另外，指南提到有研究顯示嗎替麥考酚酯、口服環磷酰胺對皮膚病變亦有效，但由于研究規模小，循證醫學證據不足，故未進行推薦。
糖皮激素可用于治療肺間質性病變的炎癥期，環磷酰胺有助于穩定SSc肺間質病變的病情，尤其是對于肺部病變持續進展的SSc患者。在指南中為A類推薦。另外，近幾年上市的批準用于治療特發性肺間質纖維化的藥物吡非尼酮，基于其通過抑制成纖維細胞增殖和膠原合成減少細胞和組織纖維化的機理，在臨床上也開始應用于結締組織病相關肺間質纖維化的治療中。目前對于其在SSc相關肺間質纖維化中的應用尚缺乏高質量循證醫學數據支持，遠期療效仍有待進一步觀察。
近20年，造血干細胞移植（HSCT）開始用于治療重癥自身免疫性疾病的患者，包括SSc兩個大樣本高質量RCT研究均提示應用HSCT治療可改善患者皮膚受累及穩定肺功能。一個大樣本RCT研究顯示與CTX相比，應用造血干細胞移植可提高患者的無事件生存率。但指南中申明，考慮到高風險的質量相關副作用以及早期與治療相關的死亡率，病人的篩選及醫務人員的經驗是影響造血干細胞移植治療效果的關鍵因素，干細胞移植應被考慮作為高風險臟器衰竭的快速進展型的SSc患者的治療方法。
三、肌肉和骨骼
肌肉骨骼受累是SSc患者致殘的主要原因，部分患者可以合并炎癥性肌病。對于病變早期的關節痛和肌痛即痛性腱鞘炎，可以用于非甾體抗炎藥或短程小劑量激素，對于炎癥性疾病可用**，每天6到8片，逐漸減量至維持量，每天2到3片效果不佳，只應可應用于靜脈丙種球蛋白治療。
四、肺動脈高壓
目前臨床上可通過擴張肺血管改善肺動脈高壓的藥物包括：內皮素受體拮抗劑、五型磷酸二酯酶抑制劑、前列環素類似物、鳥苷酸環化酶激動劑。
聯合用藥：包括初始聯合治療及序貫聯合治療兩種方式，聯合治療的目的在于充分發揮各個靶點藥物的作用，達到改善患者癥狀，改善生活質量的目的。目前臨床上常用的為PDE-5抑制劑和波生坦聯合，國內外均有文獻報道該方案的聯合用藥，臨床獲益優于單藥治療，但由于缺乏高質量大樣本臨床研究數據的支持，聯合用藥的方案指南中并未提及。另外需注意利奧西呱禁止與PDE-5抑制劑聯用。
五、腎臟
硬皮病腎危象（SRC）是SSC嚴重的并發癥。主要表現為進行性的高血壓和/或快速進展的腎衰竭。有研究顯示，一旦SRC診斷成立，應立即給予ACEI的藥物治療，可以改善患者的預后和生存率，在指南中亦推薦應用，但不推薦作為SSc患者常規預防腎危象的藥物。在血壓控制不佳的患者中，也可以聯用鈣通道阻滯劑、利尿劑、a受體阻滯劑等，將血壓降至正常。進展至腎衰竭需行血液透析治療或腎臟替代治療。另外，對SRC患者進行腎組織活檢，發現內皮素-1及其受體表達增加，故內皮素受體拮抗劑亦可能對SSc腎臟受累有效，相關研究尚在進行中。
六、胃腸道
在SSc患者中消化道受累的發生率僅次于皮膚，消化道的各個部位均可累及，以食管受累最常見，尚無藥物可以阻止消化道病變進展，故目前以對癥支持治療為主。1.抑酸劑：質子泵抑制劑對胃食道反流病、食道潰瘍和食道狹窄均有效,效果優于H2阻滯劑。2.促胃動力藥:胃復安、多潘立酮可用于治療SSc相關的功能性消化道動力失調如吞咽困難、胃食道反流病、飽腹感等。3.抗生素:盡管盡管尚缺乏大樣本的研究，但有研究顯示SSc患者存在小腸細菌過度生長引起胃脹氣和腹瀉癥狀，故專家建議間斷或變換的應用抗生素，避免耐藥。
七、中醫療法
國內有眾多的文獻探討中醫藥治療的療效，包括中藥、熏洗、針灸等。有文獻報導，參麥開肺散可以改善肺纖維化患者的肺功能指標、血氣分析指標等；活血祛瘀方熏洗可以改善彌漫性系統硬化癥患者的皮膚硬化癥狀，提高生活質量；針灸結合拔罐、熱敷、穴位注射等亦對患者有效。
八、新興療法
近年來，有眾多報道認為生物制劑對于治療SSc的安全性和有效性都是值得肯定的，如利妥昔單抗、妥珠單抗、TNF-a拮抗劑均可改善患者的關節癥狀，且有研究發現前兩者亦可顯著改善SSc患者的皮膚評分，血漿置換對皮膚、關節肌肉受累均有效，但由于部分研究仍為在研項目，僅為初步結論，或指南制定時所納入的針對這些療法的資料有限，指南并未對這些治療方法進行推薦，但不推薦并不意味著無效，這些治療方法仍需進一步研究證實。
預后與展望：
病人的預后，主要取決于內臟器官受累的程度，合并心、肺、腎病變者預后差，但隨著近年來新型藥物、新的治療方案在SSc中的應用，雖然沒有大規模隨機對照研究數據做基礎，但證據顯示依靠這些治療方案，SSc死亡率已較前明顯下降，但也須認識到這些治療方法還不夠完善，仍需長期隨訪觀察遠期療效，但相信隨著研究的深入，SSc的治療會越來越完善，進一步降低SSc患者的死亡率，提高患者的生存率及生活質量。