預后：系膜增生性腎小球腎炎多數患者預后良好，少數病例自動緩解。因病理改變及臨床表現不同，故病程相差較大。一般認為，單純血尿患者較少進入腎功能衰竭；長期少量蛋白尿伴或不伴血尿患者，病程一般較長；大量蛋白尿患者出現腎功能衰竭的時間明顯早于前兩類患者；大量蛋白尿伴高血壓患者，多數在數年內進入腎功能不全期。系膜增生性腎小球腎炎的預后與多種因素有關：兒童預后較好，尤以6歲以下者預后好；臨床表現為單純血尿或輕度蛋白尿伴或不伴血尿者預后良好；早期出現高血壓、腎功能減退或持續大量蛋白尿者往往預后不良；腎活檢病理改變為輕度系膜增生不伴局節段性腎小球硬化者預后良好；重度系膜增生，疊加局灶節段性腎小球硬化、腎間質纖維化及腎小管萎縮者，預后惡劣。這類病人腎移植后再發生率高達40%～60%；對激素治療敏感者預后較好；而對激素依賴或不敏感者預后差。
預防：系膜增生性腎小球腎炎發病和預后與多種因素有關，所以預防要從自身健康著手，平時注意適當休息，避免勞累，合理飲食，科學鍛煉，增強體質，提高免疫力，避免接觸有毒物質、有害藥物及化學物品，減少其對機體的損害，以防各種疾病發生。對系膜增生性腎小球腎炎病情重者如表現為腎病綜合征或已有并發癥出現，會因直接影響病人療效和長期預后，故應積極預防和對癥治療。詳細參見腎病綜合征預防。