紅霉紅絲霉素在臨床上可作為下列感染的選用藥物:
1.溶血性鏈球菌、肺炎鏈球菌等所致的急性扁桃體炎、急性咽炎、鼻竇炎。
2.溶血性鏈球菌所致猩紅熱、蜂窩織炎。
3.肺炎支原體肺炎、肺炎衣原體肺炎。
4.氣性壞疽、炭疽、破傷風。
5.白喉（輔助治療）及白喉帶菌者。
6.沙眼衣原衣原體結膜炎。
7.衣原體屬、支原體屬所致泌尿生殖系感染。
8.李斯特菌病。
9.軍團菌肺炎（軍團菌病）。
10.淋球菌感染。
11.空腸彎曲菌腸炎。
12.厭氧菌所致口腔感染。
13.百日咳。
14.放線菌病。
15.皮膚科主要用于非淋菌性尿道炎（宮頸炎）、淋病、梅毒、軟下疳、衣原體淋巴肉芽腫（性病性淋巴肉芽腫）、痤瘡以及金黃色葡萄球菌性皮膚感染、猩紅熱等。