線粒體核糖體各組分由分別屬于細胞核與細胞質的兩個基因組編碼,所以線粒體核糖體需要兩個基因組共同表達來形成。哺乳動物細胞核中編碼線粒體核糖體各組分的基因比其編碼80S核糖體的基因以更快的速度進化著。 [10-11]
線粒體核糖體中的所有核糖體蛋白質皆由核基因編碼,并由80S核糖體合成。 [12] 這些核糖體蛋白質需從細胞質基質中運送到線粒體內以完成線粒體核糖體的裝配。