步驟一：接種
組織培養的接種是指將滅過菌的材料，在無菌的情況下，切成小塊，放入培養基的過程。科研、生產部門的接種工作，多在無菌室或超凈工作臺上進行，中學可制作接種箱，在箱內進行接種。接種的方法步驟如下：
①在無菌室或接種箱中放好接種時所需要的酒精燈、貯存70%酒精和棉球的廣口瓶、各種鑷子、接種針、解剖刀、手術剪、火柴、培養基等。
②在無菌室或接種箱內用紫外燈滅菌（無菌室照射20～50分鐘，接種箱照射15分鐘）。
③放入已滅菌的接種材料（用培養皿盛取）。同時，操作人員用酒精棉球擦手，并對接種工具用酒精燈火焰燒灼。
④用手術刀片將材料切割成若干片段，并迅速接種入培養基中。接種時，錐形瓶（或試管）應斜向火焰，在酒精燈火焰附近操作。
⑤材料接種好后，將錐形瓶瓶口在酒精燈火焰上轉動燒一遍，蓋好瓶蓋，注明材料名稱及接種日期。
材料接種后，應置于26～28℃的培養室中進行培養。
步驟二：植株誘導
本階段是組織培養中最重要的一環。在培養基中植物 激素的作用下，外植體通過三條途徑迅速增殖，這就是側芽增殖、誘導不定芽的形成和誘導胚狀體的形成。
側芽增殖
種子植物的每個葉腋中通常都存在著腋芽，在一定條件下可以使它生長。現在知道頂端優勢抑制側芽生長，可被外源的細胞分裂 素打破，所以在利用側芽增殖這條途徑時，培養基中幾乎都要加入細胞分裂素（有時也加入少量生長素）。由于細胞分裂素的持續作用，側芽不斷分化和生長，逐漸形成芽叢。如果反復切割和轉移到新的培養基上繼代培養，就可在短期內得到大量的芽。
側芽增殖的主要優點是能保持遺傳的穩定性，因為莖尖的細胞常是均一的二倍體細胞，它不易受培養條件的影響而發生變異，也易于保持嵌合體的性狀。目前已有近百種植物可以用這種方法進行繁殖，如草毒（Fragaria ananassa Duch.）、蘋果、葡萄（Vitis vinifera L.）、唐菖蒲（Gladiolus gandavensis Houtt.）、非洲菊、月季（Rosa chinensis Jacq.）、甜菜（Beta vulgaris L.）和鳳梨。
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