按外植體分，植物組織培養可分以下幾類：
1、胚胎培養植物的胚胎培養，包括胚培養、胚乳培養、胚珠和子房培養，以及離體受精的胚胎培養技術等。
2、器官和組織培養器官培養是指植物某一器官的全部或部分或器官原基的培養，包括莖段、莖尖、塊莖、球莖、葉片、花序、花瓣、子房、花藥、花托、果實、種子等。組織培養有廣義和狹義之分。廣義：包括各種類型外植體的培養。狹義：包括形成層組織、分生組織、表皮組織、薄壁組織和各種器官組織，以及其培養產生的愈傷組織。
3、細胞培養細胞培養包括利用生物反應器進行的，旨在促進細胞生長和生物合成的大量培養系統和利用單細胞克隆技術促進細胞生長、分化直至形成完整植株的單細胞培養。
4、原生質體培養植物原生質體是被去掉細胞壁的由質膜包裹的、具有生活力的裸細胞。