移植能否成功，在很大程度上取決于供者與受者的組織相容性。所謂組織相容性，就是指不同個體間進行組織或器官移植時，移植物與宿主是否能相互“容忍”。如能“容忍”移植物就能存活，否則，移植物將被排斥或移植物使宿主受損。供受兩者的組織相容性如何，是由組織相容性抗原決定的。組織相容性抗原分為：
(1)主要組織相容性抗原 其免疫原抗性較強，所引起的免疫排斥反應發生得快且強烈，在移植免疫中主要涉及的是主要組織相容性抗原。
(2)次要組織相容性抗原
其免疫原性較弱，引起的免疫排斥反應發生得慢而弱。但其重要性也不可忽視，因為由于組織配型技術的進展，可在一定程度上控制主要組織相容性抗原引起的免疫排斥反應，而對次要組織相容性抗原了解甚少，尚無法控制。
(3)其他參與排斥反應發生的抗原 如人類ABO血型抗原，組織特異性抗原，內皮細胞抗原，SK抗原，種屬特異性糖蛋白抗原