6月15日，Genes & Development雜志發表了中科院生物物理研究所劉迎芳實驗室和北京生命科學研究所(NIBS)王曉晨實驗室的合作研究成果—— Structural Study of TTR-52 Reveals the Functional Mechanisms of a Bridging Molecule in Apoptotic Cell Engulfment。該工作通過結構和功能研究，揭示了在秀麗線蟲凋亡細胞的清除過程中，橋聯分子TTR-52介導吞噬細胞識別凋亡細胞的作用機制。
細胞凋亡后需要被及時清除以維持機體平衡。在線蟲中，TTR-52是一個介導凋亡細胞和吞噬細胞的橋聯分子，通過識別凋亡細胞上外翻的磷脂酰絲氨酸( PS )來識別凋亡細胞，同時TTR-52也可以結合吞噬細胞上的受體CED-1，進而介導凋亡細胞的吞噬。從序列分析來看，TTR-52類似于 transthyretin，一種甲狀腺激素結合蛋白。但是過去報道的transthyretin都不具有這種介導凋亡細胞吞噬的功能。為了研究TTR- 52的分子機制，研究人員希望得到TTR-52的晶體結構。在研究初期，重組表達的TTR-52蛋白非常容易聚集成不均一的高聚體，這給結晶工作帶來很大的困擾。通過Alanine scanning方法篩選大量的突變體，研究人員最終發現一個突變體可以形成少量穩定的二聚體，經過晶體篩選，最終解析了這個突變體的晶體結構。并以此突變體為依據，構建了野生型蛋白的結構模型，并進行了功能分析和實驗印證。
晶體結構顯示，TTR-52分子形成一個開放的β桶結構，與含有8個β折疊片的β桶和β三明治結構都不同，TTR-52由7個β折疊片組成。TTR-52的C端因為缺少一個β折疊片，造成部分疏水核心暴露，這種獨特的結構特征暗示其具有生物學意義。隨后的體內和體外實驗都證明，TTR-52利用該疏水區域與吞噬受體CED-1結合。此外，TTR-52的第二、第三個 loop區域形成一個杯裝的正電區，這和transthyretin很不同，卻和其他PS結合蛋白如PKCα, TIM4具有類似之處。經過突變實驗，研究發現TTR-52的這兩個loop區域可以通過陽離子介導PS的結合，從而識別凋亡細胞;此外，晶體結構中還觀察到TTR-52可以形成背靠背的二體，在該二體界面上進行突變可以將二體打開，但是該單體蛋白介導凋亡細胞吞噬的功能大大下降，該結果暗示由二體作為基本單元可能是TTR-52發揮功能的形式。
該研究不僅揭示了線蟲細胞凋亡中TTR-52介導吞噬細胞識別凋亡細胞的作用機制，而且對了解其他高等生物中橋連分子介導的凋亡細胞吞噬機制也有一定指導作用。
中科院生物物理所康彥勇博士、梁歡歡博士和NIBS趙東風博士為本文的共同第一作者。王曉晨博士與劉迎芳研究員為共同通訊作者。此外，其他一些人員也在研究過程中提供了幫助和建議。該項工作得到科技部、基金委、中國科學院及北京市政府等方面的資助。(http://www.ebiotrade.com/)
PALL鼓勵中國科研工作者SCI文章發表活動 30000獎金等著您!
1月14日，中國科學院廣州地球化學研究所（以下簡稱廣州地化所）舉辦新聞發布會宣布，該所研究團隊在納米晶體結構解析技術與儀器研制方面取得重大突破：成功攻克三維電子衍射技術測定微納米晶體樣品漂移難題，并研......
隨著人類對深空深地等未知世界和納米功能材料等應用領域的探索，解析亞微米至納米尺度物質的晶體結構已成為科學認知與高新技術發展的重要需求。傳統單晶X射線衍射技術難以突破納米尺度晶體的解析瓶頸，而且存在成本......
近日，意大利國家研究委員會（CNR）的研究團隊宣布了一項在量子物理領域的重大突破。他們成功利用光的特性創造出一種前所未有的物質狀態——“超固體”。這一發現不僅為量子物質的研究開辟了新的道路，還挑戰了我......
美國紐約大學研究人員開發了一項創新技術。該技術使人能夠以前所未有的方式窺視晶體結構，仿佛賦予人眼X射線般的超能力。這項名為“晶瑩剔透法”的新技術，將透明粒子、顯微鏡與激光技術相結合，使科學家能夠看到構......
英國劍橋晶體學數據中心（CCDC）收錄的近千個晶體結構的數據條目可能是論文工廠的產物，機構已將其標記為可疑條目，并對其進行審查。CCDC是化學家尋求晶體結構信息的一個必查資源庫，存放了結晶學領域許多期......
RNA結合蛋白(RBP)在癌癥發展和治療中發揮重要作用。然而，需要進一步確定可能作為癌癥治療靶點的促腫瘤RBP及其伴侶。2022年7月20日，海軍軍醫大學曹雪濤團隊在SignalTransductio......
近日，中國科學院上海有機化學研究所蔣洪課題組在CellChemicalBiology雜志上在線發表題為“APhotoaffinityLabelingStrategyIdentifiedEF1A1asa......
一種新型高致病性冠狀病毒(SARS-CoV-2)自2019年12月以來肆掠全球，應對這一疫情的關鍵是了解病毒的受體識別機制，調節其感染性、發病機制和宿主范圍。而在分子和原子水平了解SARS-CoV-2......
3月2日，國際學術期刊《自然-植物》（NaturePlants）在線發表了題為“Structuralbasisformonolignoloxidationbyamaizelaccase”的研究論文，該......
越來越多的證據表明，轉錄控制和染色質活性在很大程度上涉及調節類的RNA，這可能會產生特定的RNA結合蛋白（RBPs）。盡管多個RBP與轉錄控制有關，但目前尚不清楚RBP如何直接作用于染色質。2019年......