1b)將1μL的染色混合液放至12 mm×75 mm的玻璃試管的底部。加入25μL細胞懸浮液，轉動手腕輕柔地混合。
2b)將10μL的該混合液放在一干凈的顯微鏡載玻片上，蓋上22 mm2的蓋玻片。用一 落射光顯微鏡的40×到60×的干物鏡和一適合觀察熒光素的濾光片結合起來檢查。
3b)計數至少200個細胞，記錄正常和凋亡的細胞核的數量。
活的和死亡的非凋亡的細胞核呈現熒光綠色，而且有「結構」；熒光強度變化反映常染色質和異染色質的分布。而凋亡的核，在核周邊有很高的濃縮的半月斑；另外，整個核表現為一個或一群無特色的、明亮的、球狀的顆粒。更進一步的凋亡，細胞會失去DNA或被弄碎成「凋亡小體」，而且整體的明亮度低于正常細胞。
4b)計算凋亡細胞的百分比（凋亡指數）如下：
凋亡細胞%=(細胞總數-活細胞總數)/細胞總數×100% 展開 | 