細胞分裂素最明顯的生理作用有兩種：
一是促進細胞分裂和調控其分化。在組織培養中，細胞分裂素和生長素的比例影響著植物器官分化，通常比例高時，有利于芽的分化；比例低時，有利于根的分化。
二是延緩蛋白質和葉綠素的降解，延遲衰老。
