細胞及組織破碎的方法多種多樣，大致可以分為四類：
一、機械破碎：
1、研磨法。
2、組織搗碎法。
3、離心機分離法。
4、超聲波法。
5、壓榨法。
6、凍融法。
二、溶脹和自溶：
1、溶脹：
細胞膜為天然的半透膜，在低滲溶液（如低濃度的稀鹽溶液）中，由于存在滲透壓差，溶劑分子大量進入細胞，從而引起細胞膜發生脹破。
2、自溶：
由于細胞本身所具有的各種水解酶（如蛋白酶和酯酶等）的作用而發生溶解的現象。
三、化學處理：
用脂溶性溶劑或表面活性劑處理細胞時，可以使細胞壁、細胞膜部分溶解，進而使細胞釋放出各種酶類物質，最后導致整個細胞破碎。
四、生物酶降解：
生物酶有降解細菌細胞壁的功能，首先是細胞壁降解，進而因滲透壓差引起細胞膜破裂，最后導致細胞完全破碎。