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  • 發布時間:2019-04-05 13:12 原文鏈接: 細胞核連綴分析實驗_體外細胞核連綴反應

    實驗材料

    組織

    試劑、試劑盒

    EDTASDS蛋白酶 K

    儀器、耗材

    玻璃試管

    實驗步驟

    1. 融解從 1 g 組織或 5 瓶培養皿細胞制備、凍存于 NSB 中的細胞核。1000 g 離心 5 分鐘,去上清,用 200 μl HRB 輕輕吹打重懸。

    2. 將懸液轉至一個帶有抗酚螺帽的硅化玻璃試管,37℃ 水浴 5 到 15 分鐘(由預實驗決定)。孵育過程中,偶爾輕輕攪動細胞核,避免沉于管底。

    3. 加入 1.5 ml HSB 和 90 μl DNA 酶Ⅰ(終濃度 100 單位/ml)終止反應,37℃ 水浴 3~5 分鐘,同時劇烈吹打直至不再黏稠。

    4. 依次加入 40 μl 0.5 mol/L EDTA,40 μl 25% SDS 與 20 mg/ml 蛋白酶 K,混勻,37℃ 水浴 30 分鐘。

    5. 熱酸酚抽提除去蛋白質和大部分 DNA:加 2.5 ml 抽提緩沖液,然后加等量預熱到 65℃ 的由抽提緩沖液飽和的酚,于 65℃ 劇烈混合 10 分鐘。

    6. 將試管置于冰上 5 分鐘,然后于 2000 g 離心 15 分鐘分離水相與有機相。吸去下層有機相,留下水相于界面。

    7. 加等量新鮮飽和酚,如第 5 步再抽提一次。

    8. 將水相吸出到一個新離心管,用等量氯仿抽提一次。將上層水相吸出到一個新離心管。

    9. 加 100 μg 酵母 tRNA 載體與 2.5 倍體積冰冷的乙醇,于 -20℃ 放置 1 到 18 小時沉淀 RNA。

    10. 10000 r/min 離心 10 分鐘,去上清,再用 1 ml TE 緩沖液重懸。

    11. 如果 RNA 用作濾膜雜交的探針,最好做(也可不做)一步額外的清洗。

    (1) 往第 10 步得到的 1 ml RNA 樣品中加 1 ml 冰冷的 10% TCA,冰浴 10 分鐘以沉淀 RNA。

    (2) 合適的收集裝置(如微孔濾器),通過真空抽濾將沉淀收集于一張直徑 25 mm 的硝酸纖維素濾膜上,在濾器中用冰冷的乙醇清洗濾膜。

    (3) 將濾膜放在一個硅化玻璃液閃計數管的底部,于 65℃ 分 2~3 次各用 1 ml 水沖洗,合并收集沖洗液。

    (4) 乙醇沉淀濃縮 RNA ( 即加甲酸鈉至 0.2 moI/L,加二倍體枳乙醇,于 10000 r/min 離心 10 分鐘)或用真空離心蒸發干燥器濃縮 RNA。

    展開 


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